Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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SEMA3BQ13214 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SEMA3BQ13214 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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