Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms