Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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