Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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