Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms