Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF9Q00978 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms