Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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