Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
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CENPFP49454 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CENPFP49454 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CENPFP49454 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CENPFP49454 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CENPFP49454 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CENPFP49454 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CENPFP49454 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CENPFP49454 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CENPFP49454 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CENPFP49454 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CENPFP49454 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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CENPFP49454 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CENPFP49454 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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