Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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