Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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