Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TM6SF1Q9BZW5 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms