Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRRTQ9BXP5 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SRRTQ9BXP5 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms