Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
AP5B1Q2VPB7 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms