Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms