Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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