Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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