Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms