Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms