Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms