Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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