Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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CUL3Q13618 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CUL3Q13618 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CUL3Q13618 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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CUL3Q13618 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CUL3Q13618 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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