Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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