Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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