Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PGGT1BP53609 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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