Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTPAP49638 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTPAP49638 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
TTPAP49638 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
TTPAP49638 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TTPAP49638 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TTPAP49638 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TTPAP49638 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TTPAP49638 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms