Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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