Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms