Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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