Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms