Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms