Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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