Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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