Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms