| RUNX3 | Q13761 | ZNF84-212 | ENST00000542874 | 540 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006518.2-202 | ENST00000544947 | 297 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL358333.1-201 | ENST00000555115 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138305.2-201 | ENST00000561595 | 556 nt | TSL 4 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090312.2-201 | ENST00000582687 | 378 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093227.3-202 | ENST00000586606 | 704 nt | APPRIS P5 TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VN1R84P-201 | ENST00000593697 | 235 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC072062.1-205 | ENST00000595058 | 962 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLIC4P2-201 | ENST00000601934 | 717 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND3P19-201 | ENST00000603825 | 345 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009948.4-201 | ENST00000604692 | 675 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL392112.1-201 | ENST00000605115 | 829 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355816.1-201 | ENST00000607951 | 118 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMAD5-AS1_2.1-201 | ENST00000617906 | 131 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC123767.1-202 | ENST00000620407 | 817 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CR392039.4-201 | ENST00000624968 | 501 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC127502.3-201 | ENST00000636170 | 1206 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IFI16-208 | ENST00000448393 | 2245 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPSR1-AS1-205 | ENST00000436945 | 1406 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EMCN-209 | ENST00000511970 | 1377 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC38A11-204 | ENST00000409662 | 1542 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCF11-AS1-201 | ENST00000602322 | 1516 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01625-201 | ENST00000454788 | 1690 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLOD2-204 | ENST00000461497 | 3043 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERMN-205 | ENST00000410096 | 3793 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPTE2-201 | ENST00000255310 | 1562 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB3C-201 | ENST00000282878 | 8896 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP170P1-201 | ENST00000502249 | 4587 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM169A-201 | ENST00000389156 | 5990 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFL2-202 | ENST00000341223 | 3131 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANKRD36P1-201 | ENST00000344424 | 659 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MT-CO3-201 | ENST00000362079 | 784 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP374-201 | ENST00000362939 | 125 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZBTB8OS-202 | ENST00000373501 | 598 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-146P-201 | ENST00000384602 | 108 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR525-201 | ENST00000384978 | 85 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-603P-201 | ENST00000411403 | 107 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354733.1-204 | ENST00000412069 | 424 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009505.1-201 | ENST00000413151 | 424 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LURAP1L-AS1-201 | ENST00000417638 | 799 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01673-201 | ENST00000426418 | 468 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL009174.1-201 | ENST00000426577 | 416 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357833.2-201 | ENST00000426811 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162725.2-201 | ENST00000430545 | 748 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359706.1-201 | ENST00000437748 | 315 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLEC5A-202 | ENST00000438351 | 743 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P22-202 | ENST00000451823 | 572 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010976.1-211 | ENST00000454503 | 644 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092155.2-201 | ENST00000454675 | 477 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133351.1-201 | ENST00000456189 | 417 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA59A-201 | ENST00000459326 | 152 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZBTB8OS-205 | ENST00000465588 | 548 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P15-201 | ENST00000488067 | 348 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC131211.1-201 | ENST00000497285 | 483 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010273.1-201 | ENST00000504129 | 946 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021678.1-201 | ENST00000505195 | 936 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BTF3L4P4-201 | ENST00000506381 | 449 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093831.1-201 | ENST00000509166 | 434 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02496-201 | ENST00000509559 | 584 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02113-201 | ENST00000510302 | 336 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113167.1-201 | ENST00000512941 | 570 nt | TSL 4 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | APOOP4-201 | ENST00000513530 | 597 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP287-201 | ENST00000516546 | 266 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP283-201 | ENST00000517197 | 270 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC008489.1-201 | ENST00000524271 | 483 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB3IP-214 | ENST00000550847 | 670 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DUXAP6-201 | ENST00000553858 | 601 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133279.2-201 | ENST00000556546 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM96A-206 | ENST00000559950 | 561 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084757.1-201 | ENST00000559987 | 490 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF001550.1-201 | ENST00000572747 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5004-201 | ENST00000579078 | 107 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4325-201 | ENST00000583049 | 90 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC234772.3-201 | ENST00000602277 | 528 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008638.3-201 | ENST00000603341 | 463 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093424.1-201 | ENST00000604999 | 338 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z99289.3-201 | ENST00000605586 | 594 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007563.2-202 | ENST00000607591 | 394 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8H2-202 | ENST00000618136 | 1038 nt | APPRIS ALT1 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018926.3-201 | ENST00000618841 | 406 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL109659.3-201 | ENST00000624985 | 950 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL928596.1-201 | ENST00000636738 | 632 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C3-203 | ENST00000641740 | 1093 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATM-203 | ENST00000452508 | 12954 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GTDC1-206 | ENST00000409214 | 2954 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRL2-210 | ENST00000370728 | 6302 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC046144.1-201 | ENST00000478559 | 1853 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138393.1-206 | ENST00000540997 | 1886 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAB3-203 | ENST00000378930 | 6255 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NLGN1-206 | ENST00000457714 | 8242 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SERPINI2-206 | ENST00000471111 | 1331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-87P-201 | ENST00000363727 | 170 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR513B-201 | ENST00000385136 | 84 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P8-201 | ENST00000391458 | 268 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357075.1-201 | ENST00000404107 | 726 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC234782.4-201 | ENST00000417646 | 1048 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004552.1-201 | ENST00000419089 | 348 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LANCL1-AS1-202 | ENST00000420418 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NANOGP6-201 | ENST00000429190 | 847 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |