Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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