Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NME3Q13232 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NME3Q13232 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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