Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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IFT88Q13099 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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IFT88Q13099 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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IFT88Q13099 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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IFT88Q13099 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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IFT88Q13099 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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