Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRZ1P23471 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRZ1P23471 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRZ1P23471 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRZ1P23471 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRZ1P23471 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRZ1P23471 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRZ1P23471 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRZ1P23471 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRZ1P23471 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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