Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms