Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms