Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS4AQ9UN37 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms