Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms