Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms