Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF4Q9NR80 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms