Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms