Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNMDQ9H2S6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNMDQ9H2S6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms