Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms