Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms