Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms