Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms